Software livre na investigação cientÃfica: NeuroCAD – uma ferra menta "open-source" para auxi lio ao diagnóstico em neurologia.
Free-software in scientific research: NeuroCAD – an open-source neurology computer-aided toolkit.
Azevedo-Marques, Paulo Mazzoncini de; Oliveira, Marcelo Costa; Oliveira, Lucas Ferrari de; Rodrigues, Luciene Cavalcanti; Ribeiro, Luciana Torres; Caetano, Gustavo de Freitas; Araújo, David; Wichert-Ana, Lauro
Rev. Bras. Eng. Bioméd., vol.19, n2, p.69-75, 2003
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Resumo
Este artigo apresenta a implementação de uma ferramenta computacional "open-source" para o auxÃlio ao diagnósti co em neurologia – NeuroCAD. Esta ferramenta é resulta do de uma parceria entre o Centro de Ciência das Imagens e FÃsica Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Pre to e o Centro de Cirurgia de Epilepsia do Hospital das ClÃnicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, da Universidade de São Paulo. O NeuroCAD foi desenvolvi do em plataforma Linux sob uma filosofia "open-source", buscando suprir as necessidades apresentadas pelos pro fissionais do CIREP quanto ao processamento de imagens para auxÃlio ao diagnóstico clÃnico da Epilepsia do Lobo Temporal. A ferramenta é constituÃda por três módulos: a) um módulo de corregistro de imagens (anatômicas e fun cionais), no qual o especialista posiciona marcadores e seus respectivos pares, possibilitando operações geométricas de escala, translação e rotação; b) um módulo de análise volumétrica com segmentação manual (o sistema armaze na todos os objetos marcados e aplica o método de Cavalieri para cálculo do volume); c) um módulo de visualização, no qual as estruturas marcadas são reconstruÃdas tridimensionalmente.
Palavras-chave
AuxÃlio ao diagnóstico, Corregistro, Epi lepsia, SPECT, Visualização 3D, Volumetria.
Abstract
This paper describes the development of an open-source com puter-aided toolkit for neuroimaging applications – NeuroCAD. This toolkit was developed by the Image Science and Medical Physics Center (CCIFM) of Medical School of Ribeirão Preto and the Epelipsy Surgery Center (CIREP) of the Clinical Hospital of Medical School of Ribeirão Preto at University of São Paulo. The NeuroCAD is GNU/Linux based and has an open-source phi losophy. The toolkit source has three modules: a) The registra tion module for functional and structural images acquired in the same plane. A end-user places fiducial markers in both images. The second image is processed so that its markers match those of the first, adjusting for registration. b) The volumetric module, with manual segmentation and automatic volume calculation (Cavalieri’s principle). c) The structures marked in b) can be reconstructed tridimensionally by the third module.
Keywords
Aided diagnosis, Epilepsy, Registration, SPECT 3D visualization, Volumetry.