Research on Biomedical Engineering
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Research on Biomedical Engineering
Original Article

Software livre na investigação científica: NeuroCAD – uma ferra menta "open-source" para auxi lio ao diagnóstico em neurologia.

Free-software in scientific research: NeuroCAD – an open-source neurology computer-aided toolkit.

Azevedo-Marques, Paulo Mazzoncini de; Oliveira, Marcelo Costa; Oliveira, Lucas Ferrari de; Rodrigues, Luciene Cavalcanti; Ribeiro, Luciana Torres; Caetano, Gustavo de Freitas; Araújo, David; Wichert-Ana, Lauro

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Resumo

Este artigo apresenta a implementação de uma ferramenta computacional "open-source" para o auxílio ao diagnósti co em neurologia – NeuroCAD. Esta ferramenta é resulta do de uma parceria entre o Centro de Ciência das Imagens e Física Médica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Pre to e o Centro de Cirurgia de Epilepsia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, da Universidade de São Paulo. O NeuroCAD foi desenvolvi do em plataforma Linux sob uma filosofia "open-source", buscando suprir as necessidades apresentadas pelos pro fissionais do CIREP quanto ao processamento de imagens para auxílio ao diagnóstico clínico da Epilepsia do Lobo Temporal. A ferramenta é constituída por três módulos: a) um módulo de corregistro de imagens (anatômicas e fun cionais), no qual o especialista posiciona marcadores e seus respectivos pares, possibilitando operações geométricas de escala, translação e rotação; b) um módulo de análise volumétrica com segmentação manual (o sistema armaze na todos os objetos marcados e aplica o método de Cavalieri para cálculo do volume); c) um módulo de visualização, no qual as estruturas marcadas são reconstruídas tridimensionalmente.

Palavras-chave

Auxílio ao diagnóstico, Corregistro, Epi lepsia, SPECT, Visualização 3D, Volumetria.

Abstract

This paper describes the development of an open-source com puter-aided toolkit for neuroimaging applications – NeuroCAD. This toolkit was developed by the Image Science and Medical Physics Center (CCIFM) of Medical School of Ribeirão Preto and the Epelipsy Surgery Center (CIREP) of the Clinical Hospital of Medical School of Ribeirão Preto at University of São Paulo. The NeuroCAD is GNU/Linux based and has an open-source phi losophy. The toolkit source has three modules: a) The registra tion module for functional and structural images acquired in the same plane. A end-user places fiducial markers in both images. The second image is processed so that its markers match those of the first, adjusting for registration. b) The volumetric module, with manual segmentation and automatic volume calculation (Cavalieri’s principle). c) The structures marked in b) can be reconstructed tridimensionally by the third module.

Keywords

Aided diagnosis, Epilepsy, Registration, SPECT 3D visualization, Volumetry.
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